آنتی‌‌اکسیدان موجود در فلفل سبز می‌تواند خطر ابتلا به بیماری‌های قلبی و سرطان را کاهش دهد. فلفل سبز منبع غنی آنتی‌اکسیدان است و گنجاندن آن در وعده‌های غذایی اثرات مثبتی به همراه دارد. آنتی‌اکسیدان‌ها دارای اثر ضدپیری هستند و آسیب به سلول‌ها و مولکول DNA را کاهش می‌دهند. فلفل سبز دارای مقادیر زیادی فیبر، پتاسیم و فلاونوئیدهای ارزشمندی مانند"کاپسایسین" است.

فلانوئیدها به عنوان عوامل آنتی‌اکسیدانی در کاهش خطر ابتلا به بیماری‌های قلبی و سرطان نقش دارند. با وجود خواص فلفل سبز، مصرف آن به افراد مبتلا به بیماری آرتریت‌روماتوئید (رماتیسم) توصیه نمی‌شود و این افراد بهتر است مصرف انواع فلفل‌ها را محدود کنند.